امرالله صالح، معاون نخست رییس‌جمهور می‌گوید با وجود توافق امریکا با طالبان برای قطع رابطۀ گروۀ طالبان با شبکۀ القاعده، این گروه هنوز هم با القاعده رابطه دارد و جداسازی این دو گروه دشوار است.
آقای صالح می‌افزاید که نیروهای دولتی افغانستان سه عضو شبکۀ القاعده را در جنوب کشور در یکی از پایگاه‌های طالبان ازبین برده‌اند: «ده ماه پس از امضای توافق‌نامۀ دوحه و تعهد طالبان برای جداسازی خودشان از القاعده، نیروهای ویژۀ شجاع مان سه عضو القاعده را در یک پایگاۀ طالبان در جنوب افغانستان ازبین بردند. به‌نظر می‌رسد که این جداسازی دشوارتر از یکجا ماندن است. تأیید کارشیوه‌ها برای عملی ساختن هرگونه توافق یک نیاز است.»
وزارت داخله افغانستان نیز می‌گوید که شواهد انکار ناپذیری مبنی‌بر حفظ روابط طالبان با القاعده را در اختیار دارد.
طارق آرین، سخن‌گوی وزارت امور داخله گفت: «شواهد انکار ناپذیری وجود دارند که طالبان با گروه‌های تروریستی به‌ویژه با شبکۀ القاعده رابطه دارند. کشته شدن یکی از رهبران القاعده در غزنی، هلمند و چند ولایت دیگر نشان از حضور القاعده زیر نفوذ طالبان است.»
وزارت دفاع ملی نیز با پخش تصویرهایی گفته‌است که نیروهای امنیتی دو روز پیش در یک حملۀ هوایی در ولسوالی ناوۀ ولایت هلمند چهار عضو شبکۀ القاعده را ازبین برده‌اند.
دوماه پیش، ابو محسن المصری که فرد شماره دوم شبکۀ القاعده گفته شده‌است نیز در یک عملیات نیروهای دولتی در ولسوالی اندر ولایت غزنی کشته شد.
پیش از این وزیرخارجۀ امریکا شمار فرماندهان شبکۀ القاعده را در افغانستان دو صد تن گفته‌است.
فواد امان، معاون سخن‌گوی وزارت دفاع ملی بیان داشت: «هنوز هم جنگ‌جویان القاعده در میان طالبان حضور دارند و با حمایت طالبان علیه مردم و نیروهای دولتی افغانستان جنگ می‌کنند.»
اما مولوی عبدالحکیم شرعی، یک عضو شورای رهبری گروۀ طالبان می‌گوید که این گروه به هیچ جنگ‌جوی خارجی اجازۀ استفاده از خاک افغانستان را در برابر کشورهای دیگر نمی‌دهد: «تسلیمی اسامه بن لادن خلاف شریعت بود. حالا هم همراه آنان این توافق نشده‌است که یک مسلمان را به آنان تسلیم می‌کنیم، بلکه این توافق شده‌است که به آنان جای نمی‌دهیم.»
در ماه جوزای امسال، گروۀ نظارت بر تحریم‌های سازمان ملل متحد در گزارشی به شورای امنیت این سازمان گفت که رهبران بلندپایۀ شبکۀ القاعده و صدها جنگ‌جوی این شبکه در افغانستان فعالیت دارند - گزارشی که از سوی طالبان بی‌بنیاد گفته شده‌است.