پس از درگیری‌های مرزی میان نیروهای افغانستان و پاکستان، شماری از مهاجران افغان در پاکستان از بدرفتاری پولیس آن کشور شکایت دارند.
شورای مهاجران افغانستان در پاکستان با انتقاد از بازداشت‌های خودسرانه از سوی پولیس پاکستان، می‌گوید که پولیس پاکستان در شهر کراچی بیش از ۱۰۰ تن را بی‌گناه بازداشت و آزار و اذیت کرده است.
به گفته‌ی مسوولان این شورا، این بازداشت‌ها نگرانی‌های زیادی را در میان مهاجران افغان ایجاد کرده است.
میراحمد رووف، ریس شورای مهاجران افغانستان در پاکستان گفت: «جریمه‌های بسیار سنگین گذاشتند و به بهانه مهاجران غیرقانونی اقدام کردند و این نگرانی بسیار کلان را بین دیروز و امروز بوجود آورده است.»
فیض الله ترک، مهاجر افغانستان در پاکستان در این باره می‌گوید: «ما شاهد بودیم که پولیس پاکستان روز گذشته در شهر کراچی بیشتر از صد نفر را دستگیر کرد و این روند ادامه دارد.»
از سویی‌هم، سرفراز بوگتی، وزیر داخله پاکستان با هشدار اخراج مهاجران غیرقانونی در پاکستان، بر عملی ساختن طرحی مبنی بر برگشت دادن مهاجران به کشور شان تاکید ورزیده است.
سرفراز بوگتی گفته است: «ما یک برنامه‌یی را ایجاد کرده‌ایم که از سوی اداره نیروهای استراتیژیک پاکستان نیز تایید شده است. بربنیاد این طرح، هر قدر مهاجران غیرقانونی که در پاکستان حضور دارند، از هر کشوری که باشند، هشدار دریافت کرده و به کشور شان برگشت داده خواهند شد. اما مهاجران قانونی در کشور ما همچون هر کشور دیگری، می‌توانند حضور داشته باشند.»
سرافراز بوگتی همچنان گفته است که اعضای گروه تحریک طالبان که از افغانستان وارد پاکستان می‌شود، اگر افغان باشد یا نباشد هراس‌افگن هستند و اسلام‌آباد پاسخ حملات شان را می‌دهد.
او افزود: «اعضای گروه تحریک طالبان پاکستانی که از افغانستان وارد کشور ما می‌شوند، این‌که افغان‌ها شامل آن است یا نه، برای ما فرق نمی‌کند. هر آن گروهی که بالای ما حمله می‌کند، برای ما گروه هراس افگن است و حتما پاسخ این حملات شان را خواهیم داد.»
در همین حال، وزارت مهاجران و عودت کنندگان از میزبانان پناهجویان افغان به ویژه پاکستان می‌خواهد که به حقوق جهانی پناهجویان تمکین کنند.
عبدالمطلب حقانی، سخنگوی وزارت مهاجران و عودت کنندگان به طلوع‌نیوز گفت: «از همه کشورهای میزبان می‌خواهیم که رفتار انسانی با افغان‌ها داشته باشند و حقوقی را که بربنیاد قوانین بین‌المللی داده شده، برای آنان بدهد.»
بهیجه سادات، آگاه امور مهاجران گفت: «پاکستان از مهاجرین افغانستان منحیث افزار سیاسی و اقتصادی استفاده می‌کند پس برای حل مشکلات مهاجرین افغانستان، لازم است تا دولت فعلی افغانستان با دولت میزبان و جامعه جهانی وارد گفت‌وگو شود.»
بربنیاد آمارهای وزارت مهاجرین و عودت کنندگان، نزدیک به سه میلیون شهروند کشور در پاکستان، نزدیک به سه میلیون هم در ایران و یک میلیون دیگر در کشورهای دیگر بود و باش دارند.