مسؤولان مکتب افغان ترک در هرات، می‌گویند که بامداد امروز، نیروهای پولیس و امنیتی ملی با یورش بر مکتب‌های دخترانه و پسرانۀ افغان - ترک در این ولایت، شماری از دانش‌آموزان و آموزگاران این مکتبها را بازداشت کردند.
نهاد مکتب‌های افغان - ترک، این کار نیروهای امنیتی را نکوهش کرده است و آن را خلاف قانون خوانده است.
در همین حال، جیلانی فرهاد، سخن‌گوی والی هرات می‌گوید که نیروهای امنیتی بربنیاد حکم دادگاه، ادارۀ این مکتبها را که به گفتۀ او وابسته به جنش خدمت فتح‌الله گولن است به دست گرفته‌اند.
در ماه حوت سال گذشته، مسؤولیت مکتب‌های افغان - ترک در افغانستان، به گونۀ رسمی به وزارت معارف ترکیه سپرده شد.
در آن زمان سرپرست وزارت معارف افغانستان گفته بود که حکومت افغانستان این تصمیم را ازبهر منافع ملی و ارزش‌های دوستی میان افغانستان و ترکیه گرفته شده است.
حکومت ترکیه، پس از یک کودتای نافرجام در این کشور، از حکومت افغانستان خواسته بود تا مدیریت این مکتبها را به ترکیه بسپارد؛ زیرا حکومت ترکیه ادعا می کند که این مکتبها از سوی فتح‌الله گولن، کسی که از سوی حکومت ترکیه به سازمان دهی کودتا در آن کشور متهم است، رهبری می شدند. ادعایی که همواره از سوی انجمن خانواده‌های دانش آموزان لیسه های افغان ترک رد شده است.
مکتب‌های افغان - ترک در افغانستان در ولایتهای کابل، بلخ، هرات، کندهار، ننگرهار و شهر شبرغان فعالیت دارند.