خلیلالرحمن حقانی سرپرست وزارت مهاجران حکومت سرپرست در سال ۱۹۶۶ میلادی در روستای کندو در ولسوالی گرده سیری ولایت پکتیا زاده شد و در نُه سالگی در سال ۱۹۷۵ به سبب مشکلات سیاسی و نظامی، مجبور به ترک وطن شد و به پاکستان مهاجرت کرد.
خلیلالرحمن حقانی و برادرش جلالالدین حقانی از اعضای ارشد امارت اسلامی بودند که در جنگ در برابر اتحاد جماهیر شوروی و نیروهای ائتلاف در چند دهه گذشته نیز نقش مهمی را بر عهده داشتند.
خلیلالرحمن حقانی در سال ۱۹۸۰ میلادی به رهبری برادر بزرگش جلالالدین حقانی فعالیتهای جهادی را علیه نیروهای شوروی آغاز کرد و همچون فرمانده تسلیحات سنگین نقش مهمی در این جنگ داشت.
در سال ۲۰۰۱ میلادی زمانیکه امریکا به افغانستان حمله کرد، خانه خلیلالرحمن حقانی در کابل هدف حمله هوایی قرار گرفت. در سال ۲۰۱۱ وزارت خزانهداری امریکا خلیلالرحمن حقانی را در فهرست سیاه قرار داده و جایزه پنج میلیون دالری را برای اطلاعات درباره او تعیین کرد.
گلابخان باز آگاه مسایل سیاسی درباره خلیلالرحمن حقانی به طلوعنیوز گفت: «تا جایی که من معلومات دارم، از مخالفان حکومت همواره میخواست که به کشور بیایند، در صلح و آرامش زندگی کنند و از مشکلات رهایی یابند.»
خلیلالرحمن حقانی در حاکمیت دوباره امارت اسلامی در کشور، سرپرستی وزارت مهاجران و عودت کنندگان را بر عهده داشت. مدیریت اخراج اجباری نزدیک به ۹۰۰هزار مهاجر از پاکستان و نزدیک به ۶۰۰هزار مهاجر افغان از ایران از کارکردهای مهم خلیلالرحمن حقانی به شمار میرود.
خلیلالرحمن حقانی در ۱۸ عقرب ۱۴۰۲ گفته بود: «متاسفانه اینها خیلی مشکلات دارند. اکثر کسانی که از آن سو آمدهاند از لتوکوب و گرفتن مال و پول خود شکایت دارند. ما تلاش میکنیم برای آنها زمینه کار فراهم کنیم و زمینه تعلیم را مساعد کنیم.»
خلیلالرحمن حقانی در بیشتر سخنرانیهایش بر اتحاد میان شهروندان کشور، رفع چالشهای مهاجران در کشورهای همسایه و اجرای قوانین اسلامی در کشور تاکید داشت. حل و فصل دشمنیهای چندین ساله از فعالیتهای دیگر آقای حقانی بود که تلاشهای زیادی را در این زمینه انجام داده است.
خلیلالرحمن حقانی در ۳۰ میزان سال روان خورشیدی گفت: «ما باید متحد باشیم و جوانان باید تلاش کنند تا سیرت و صورت خود را طبق احکام شریعت عیار سازند.»
خلیلالرحمن حقانی فراگیری علوم عصری را نیز از نیاز جدی در کشور میدانست. او باری در مراسم گشایش یک مکتب در پروان گفته بود که پیشرف و ترقی کشور به آموختن علم و دانش بستهگی دارد.
خلیلالرحمن حقانی سرانجام در بیستویکم ماه روان خورشیدی (قوس) در مقر وزارت مهاجران و عودت کنندگان هدف یک حمله انتحاری قرار گرفت.