سازمان تحقیقاتی اکپس گفته است که چند مساله از جمله درخواست افغانستان برای بازگرداندن چرخ‌بال‌های نظامی مستقر در ازبیکستان و ساخت کانال قوش‌تیپه سبب تیرگی روابط میان ازبیکستان و حکومت سرپرست شده‌اند. این سازمان تحقیقاتی در گزارشی یادآور شده است که با وجود روابط خوب میان ازبیکستان و امارت اسلامی، برخی اختلاف‌ها میان دو طرف نیز وجود دارند.