بر بنیاد یک فرمان رییس‌جمهور غنی، در ساختار نو وزارت صحت‌عامه، ریاست‌های خدمات دارویی، تغذی عامه و تصدی و فارمسی این وزارت به ادارۀ ملی غذا و دارو انتقال داده شده‌اند تا به ادارۀ امور ریاست‌جمهوری گزارش بدهند.
بربنیاد یک نامۀ رسمی کمیسیون مستقل اصلاحات اداری، در تشکیل نو وزارت صحت‌عامه، معینیت پالیسی باید حذف و چهارده ریاست به‌شمول مشاوریت ارشد حقوقی، حذف، تعدیل و یا به ادارۀ دیگری انتقال یابند.
وحید مجروح، سرپرست وزارت صحت‌عامه گفت: «رییس صاحب جمهور از رهبری وزارت صحت‌عامه طرحی به‌خاطر اصلاح نظام صحی افغانستان مطالبه کرد که در قالب این طرح تمرکز بر بهبود کیفیت خدمات است.»
دیده‌بان شفافیت می‌گوید که انتقال امور تخصصی به ادارۀ امور سبب سیاسی شدن امور اجرایی و نظارتی در دولت خواهد شد.
ناصر تیموری، پژوهشگر دیده‌بان شفافیت افغانستان بیان داشت: «وظایف اجرایی و تخصصی نظارت باید از سوی وزارت صحت‌عامه به‌پیش برود و ادارۀ امور باید تنها متمرکز به هماهنگی میان ارگ ریاست‌جمهوری و ادارات باشد.»
اسحق اتمر، آگاه امور سیاسی نیز اظهار داشت: «در تشکیلات دولتی صلاحیت ادارۀ امور گرفتن صلاحیت بودجوی از وزارت‌خانه‌ها نیست.»
در دو سال اخیر شماری از بخش‌های برخی از وزارت‌خانه‌ها زیر نام اداره‌های مستقل زیر نظارت ادارۀ امور ریاست جمهوری انتقال یافته‌اند.